Gayrettepe İstasyonu, hem Gayrettepe – İstanbul Havalimanı Metro Hattı hem de Büyük İstanbul Tüneli Projesi kapsamında yapımı planlanan İncirli – Söğütlüçeşme Metro Hattı’na hizmet edecek şekilde tasarlanmıştır. Ayrıca, İstasyonun doğu ucunda bulunan makaslar aracılığıyla, Büyük İstanbul Tüneli ile yolculu araç geçişinin sağlanması planlanmıştır.