Gayrettepe İstasyonu, hem Gayrettepe – İstanbul Havalimanı Metro Hattı hem de Büyük İstanbul Tüneli Projesi kapsamında yapımı planlanan İncirli – Söğütlüçeşme Metro Hattı’na hizmet edecek şekilde tasarlanmıştır. Ayrıca, İstasyonun doğu ucunda bulunan makaslar aracılığıyla, Büyük İstanbul Tüneli ile yolculu araç geçişinin sağlanması planlanmıştır.
Yeni Avusturya Tünel Açma Metodu (NATM) ile inşa edilen Gayrettepe İstasyonu, Zincirlikuyu Metrobüs Kavşağı ile Büyükdere Caddesi arasında yaklaşık 65 m derinlikte konumlandırılmıştır.
